深圳东站
深圳东站，是中国铁路广州局集团有限公司管辖的三等站，是深圳市东部地区接驳功能齐全的交通枢纽，是深圳铁路枢纽的重要组成部分，是深圳十大火车站之一。截至2018年9月，深圳东站总建筑面积6.7万平方米，主站房建筑面积2.1万平方米，可同时容纳7000多名旅客候车；截至2018年9月，车站站场规模为4台11线，设计日均最高客流量9万人次，每日始发列车77对、通过列车115对。
深圳坪山站
深圳坪山站，隶属于中国铁路广州局集团有限公司，为厦深铁路的客运二等站，是深圳市东部片区的交通枢纽。坪山站为一座紧凑型高架铁路车站，总建筑面积9992.78平方米，站房雨棚钢结构覆盖面积18131.2平方米，站台雨棚面积27535.6平方米；车站外部采用“阳光板幕墙”，通透明亮。站场规模4台8线。
深圳机场站
深圳机场站，于2019年12月15日正式开通运营，隶属中国铁路广州局集团有限公司管辖，当前是穗深城际铁路上的一座车站，未来将建设成为粤港澳大湾区内联外通的一个交通集散地。深圳机场站与深圳机场T3航站楼和深圳地铁11号线机场站之间300多米的联络通道已经实现贯通。
深圳北站
深圳北站，是由中国铁路广州局集团有限公司管辖的特等站，是深圳铁路“四主四辅”客运格局的核心车站，是深圳市规模最大、接驳功能最为齐全、设备技术最先进、客流量最大的特大型综合铁路枢纽。深圳北站分为三部分：高铁站房、东广场和西广场，占地240万平方米，设11个站台20条股道，预计年发送旅客达到5200万人次。
深圳站
深圳站，为深圳铁路枢纽的重要组成部分，是中国铁路广州局集团有限公司管辖的一等站，是中国铁路的大型口岸车站之一，是广深铁路城际列车的始发终到站之一。截至2018年8月，深圳站总建筑面积9.6万平方米，候车室面积1万平方米，可同时容纳1万名旅客候车，站场规模4台8线，单日可发送旅客10多万人次、接发列车200余趟。
西丽站
西丽站，是中国铁路广州局集团有限公司深圳平南铁路有限公司管辖的货运四等站，是平南铁路的中间站。截至2021年2月，西丽站站场东西长2300米，南北宽590米，站场占地面积约136万平方米，其中货运办公楼占地面积为500平方米。西丽站及周边配套设施总占地173.8万平方米；车站西侧标高31.5米，东侧标高9.9米。
福田站
福田站，是中国铁路广州局集团有限公司管辖的一等站，是深圳市接驳功能齐全的交通枢纽，是深圳铁路枢纽“三主三辅”中的“三辅”之一，是深圳主要高铁站点；在广深港高速铁路中，福田站的功能定位是城际站。截至2018年9月，福田站建筑总面积为14.7万平方米，候车厅层面积4.6万平方米，站场规模4台8线，地下二层候车室可同时容纳3000名旅客候车。
平湖站
平湖站，是中国铁路广州局集团有限公司管辖的四等站，是深圳主要的火车站，建于1911年，距离广州站127公里，离深圳站20公里。平湖站有多条铁路经过。截至2020年，仅有广深城际铁路在平湖站办理客运业务，其余铁路在该站均为货运停靠。
光明城站
光明城站，隶属于中国铁路广州局集团有限公司管辖，于2011年12月26日正式开通启用，途经铁路线路有：广深港高速铁路、京港高速铁路。光明城站站房外观通体白色，四周为通透的玻璃幕墙，高15米至16米。车站东西两侧为站前广场，站房周边道路环通，广场东侧布置社会车辆及出租车车辆停车场，东北侧布置公交车辆停车场，西北侧布置社会车辆停车场。