《Jolin1019》
华语流行天后蔡依林最好听的专辑《Jolin1019》，是她的第一张国语专辑，于1999年9月10日发行。这张专辑发行首周销量超过6万张，当年仅在中国台湾便卖出超过40万张的销量，不仅让蔡依林登上了玫瑰唱片、五大唱片等销量榜，更是使当年只是一个新人的蔡依林备受国内外媒体关注。可以说此张专辑打响了蔡依林在台湾乃至大陆的知名度，当年走清纯路线的蔡依林用纯净的声音响彻整个华语乐坛。专辑中的主打歌《我知道你很难过》《上街》等更是成为万千潮流少年少女心目中的神曲。蔡依林也凭借国语专辑《Jolin1019》一举获得新加坡金曲奖“最佳新人金奖”、ChannelV“亚洲区年度最受欢迎新人”和台湾TVBS劲碟民选大赏“最受欢迎新人”等多个奖项。
《城堡》
《城堡》是蔡依林2004年发行的音乐专辑，也是蔡依林加盟索尼唱片之后的第二张专辑，于2004年2月27日发行。在这张专辑中，唱片公司以“天、地、海”为企划概念，藉由“天空的飞鸟”、“森林的白马”及“深海的蓝鱼”来展现“城堡”专辑中多元曲风内容。专辑《城堡》在中国台湾的销量达30万，使蔡依林二度登上中国台湾年度唱片销量女歌手冠军。在这张专辑中，有不少买购网小编喜欢的歌曲，如《爱情36计》《LoveLoveLove》《倒带》《柠檬草的味道》《消失的城堡》《海盗》《第一优先》等，这些歌曲都非常值得一听。
《UGLYBEAUTY》
《UglyBeauty》是蔡依林的第14张个人音乐专辑，位列蔡依林专辑排名前三，由吴青峰、阿信、宋念宇、剃刀蒋、陈星翰、倪子冈等担任制作人，收录了《怪美的》《如果我没有伤口》《恶之必要》《玫瑰少年》等11首歌曲，于2018年12月26日发行。这张专辑是Jolin推出暌违乐坛四年的专辑，她以亲自参与音乐人集体创作的方式，完成专辑的歌曲。次年，该张专辑获得第30届台湾金曲奖“年度专辑”奖。
《呸》
《呸》是蔡依林发行的第13张专辑，由黄伟文和蔡依林共同制作，收录了《Play我呸》《第三人称》《电话皇后》《美杜莎》等10首歌曲，于2014年11月15日发行。《呸》的概念来自于“PLAY”的谐音，PLAY这个字包含了“剧本”和“扮演”以及“表演”等等多重涵义，正呼应着蔡依林这两年来对人生舞台有许多新的体验和领悟。这张专辑跳脱一般华语专辑框架，音乐饱满复杂且主题包罗万象。2015年，该专辑在QQ音乐年度盛典获得“最佳港台国语专辑”；在第26届台湾金曲奖同时获得“最佳国语专辑奖”和“演唱类最佳专辑奖”。
《特务J》
在蔡依林全部专辑中，只有《特务J》是蔡依林推出以特务造型风为主题的专辑，又名《爱情任务》，收录了《日不落》《爱无赦》《特务J》《冷暴力》等12首歌曲，于2007年发行。这张专辑的MV以“音乐电影”视觉为企划概念，制作公司邀请到金载沅、冯德伦以及吴嘉龙分别担任Part1任务的宿命、Part2记忆的裂痕、Part3幻觉的信仰三段故事的男主角，将专辑内的十首歌曲串连拍摄成约九十分钟的《爱情任务三部曲音乐电影》。2008年蔡依林凭借该专辑获得第六届HITO流行音乐奖年度十大华语歌曲、年度女歌手两个奖项；同年还获得第六届MusicRadio中国TOP排行榜年度最佳销售女歌手、年度最佳金曲、年度全能艺人三个奖项。
《看我72变》
《看我72变》是蔡依林2003年推出的个人第五张专辑，也是蔡依林最经典专辑，收录了《看我72变》《布拉格广场》《说爱你》《骑士精神》等在内的11首歌曲。这张专辑带来的不只是蔡依林形象上的改变，而且歌曲风格也呈现多样化；凭借该专辑蔡依林在中国台湾G-music风云榜中获得最佳女艺人奖及最佳专辑奖。2003年8月10日，专辑《看我72变》在亚洲地区的销量超过100万张；2004年3月30日，蔡依林凭借专辑《看我72变》入围第15届台湾金曲奖最佳流行音乐演唱专辑与最佳国语女演唱人奖。
《MUSE》
《MUSE》是蔡依林2012年发布的专辑，收录了《大艺术家》《马赛克》《我》《Dr.Jolin》等在内的11首歌曲，由此让蔡依林开始受到一些如SnoopLion等独立音乐者的认可，且该张专辑于2013年被台湾中华音乐人交流协会评选为推荐唱片；蔡依林也凭借该张专辑夺得台湾年度女歌手销售榜冠军。2013年5月22日，蔡依林凭借专辑《MUSE》成功获得第24届台湾金曲奖最佳国语女歌手、最佳国语专辑奖与最佳年度歌曲3项提名。
《Don’tStop》
《Don'tStop》是蔡依林的音乐专辑，由李偲菘、李伟菘、陈伟等担任制作人，共收录10首歌曲，于2000年4月26日发行。这张专辑是蔡依林的个人第二张音乐专辑，专辑同名曲《Don'tStop》翻唱自英国团体“SClub7”的专辑主题歌。《Don'tStop》专辑中的蔡依林，唱快歌热力十足，唱慢歌又足够楚楚动人，这满足少女歌手走红的特质，她凭借该专辑在一众出道歌手中杀出重围也很正常。2001年，专辑歌曲《Don'tStop》还获得第7届华语榜中榜“最受欢迎歌曲奖”。
《J-GAME》
《J-GAME》又名《野蛮游戏》，是蔡依林的第七张国语专辑，也是脱离周杰伦后的首支作品，收录了《野蛮游戏》《天空》《许愿池的希腊少女》《独占神话》《睁一只眼闭一只眼》等在内的11首歌曲，于2005年4月25日发行。虽然没有了周杰伦，但是没有影响到整张专辑质量，王力宏的加盟给专辑带来了嘻哈的元素，蔡依林的唱功也有所进步。专辑以“Game”的概念为基点，希望传达“创意冒险”、“勇于尝鲜”的生活态度。专辑名称来源于三组概念：“Jisco-Game”、“Jissing-Game”、“Jancy-Game”，以呈现专辑中三种不同的曲风。2005年，蔡依林凭借该专辑获得新城国语力颁奖典礼亚洲歌手大奖。
《舞娘》
《舞娘》是蔡依林的第八张国语专辑，也是蔡依林最好的专辑之一，收录了《舞娘》《马德里不思议》《玩美》《唇唇欲动》《假装》等在内的11首歌曲，于2006年5月12日发行。专辑《舞娘》在40天内全亚洲销量突破200万张，为蔡依林带来的不仅仅是首度登上华语年度销售总冠军的位置，也让屡次与台湾金曲奖绝缘的蔡依林在第18届颁奖典礼上获得了“最佳国语女歌手”以及“最受欢迎女歌手”等多项奖项。