蓝鳍金枪鱼的现存数量因物种和区域差异较大，且难以精确统计，主要情况如下：
太平洋蓝鳍金枪鱼：目前资源量约 15 万吨（约 200 万条），但这一数据较 1970 年代下降了 97%。俄罗斯远东地区 2026 年首次批准 30 吨商业捕捞配额，反映其分布范围有所北移。
大西洋蓝鳍金枪鱼：分为东西两个种群。西大西洋种群数量未知，但通过重建计划实现可持续管理；东大西洋种群经过 20 年保护，资源量恢复至历史水平的 22%。
南方蓝鳍金枪鱼：数据较少，但整体处于严重衰退状态，部分区域已实施禁渔。
总体来看，蓝鳍金枪鱼因过度捕捞和气候变化仍面临灭绝风险，全球种群数量约为工业化前的 4%。各国正通过配额制度、禁渔区和养殖技术等措施进行保护。